Bonjour,
La prochaine session du séminaire Performance et Généricité du LRDE
(Laboratoire de Recherche et Développement de l'EPITA) aura lieu ce
mercredi 2 juin 2010 (14h-17h) en Amphi 4 au Kremlin-Bicêtre.
Au programme:
* 14h: Généricité et topologie discrète en C++
-- Julien Lamy
http://www-ulpmed.u-strasbg.fr/ipb/
Le traitement d'images est par nature un procédé discret, au cours
duquel un signal continu est décomposé en un ensemble de pixels, ou de
voxels pour des images tri-dimensionnelles. Au niveau géométrique, cette
nature discrète pose peu de problèmes, car la plupart des opérations
géométriques sont indépendantes de la grille sous-jacente ; au niveau
topologique, le problème est tout autre. Deux des notions fondamentales
de la topologie, le voisinage et la connexité, sont radicalement
différentes entre un espace continu et un espace discret : il est entre
autres impossible de subdiviser un voisinage discret de façon infinie
comme c'est le cas dans un espace euclidien.
Bien que certaines bibliothèques de traitement d'images contiennent des
algorithmes topologiques, notamment de squelettisation, le type de
voisinage utilisé par ces algorithmes est généralement fixé par le code,
ce qui empêche une adaptation facile à un autre type de connexité ou à
un espace de dimension différente.
Ce séminaire présente une méthode générique pour intégrer les notions
discrètes de voisinage et de connexité à une bibliothèque de traitement
d'images programmée en C++. Je montrerai également comment obtenir de
façon simple un algorithme de squelettisation homotopique en utilisant
ces notions.
-- Julien Lamy est titulaire d'un doctorat de l'Université de Strasbourg.
De 2001 à 2006, il a travaillé au sein de l'équipe de R&D de l'IRCAD
(Institut de recherche contre les cancers de l'appareil digestif,
Strasbourg) au développement d'algorithmes de traitement d'images
médicales. Depuis 2008, il est ingénieur de recherche au Laboratoire
d'imagerie et de neurosciences cognitives de l'Université de Strasbourg.
* 15h: Interface générique pour la parallélisation d’applications de
recherche en imagerie biomédicale
-- Yann Cointepas
http://www.lnao.fr/
Le projet BrainVISA (http ://brainvisa.info) est en train de développer,
avec le soutien du projet européen HiPiP (http ://hipip.
eu), une architecture générique pour la parallélisation des
applications. Cette architecture fournira un accès à divers moyens
de calculs (fermes de stations de travail, clusters, centres de calculs,
etc.) en s’appuyant sur des solutions existantes pour la gestion
des ressources (Sun Grid Engine, Condor, LSF, etc.) Cette architecture
est développée pour répondre aux besoins croissants
de moyens de calcul dans le monde de la recherche en neuroimagerie. Au
cours de ce séminaire, j’aborderai rapidement le
contexte de la recherche en neuroimagerie en me focalisant sur les
besoins en parallélisation d’applications. Ensuite, je détaillerai
la solution que nous avons choisie pour répondre à ces besoins.
-- Yann Cointepas a obtenu un doctorat de Traitement du signal et des
images à l’Ecole Nationale des Télécommunications de Paris en 1999.
Depuis 2003, il a un poste d’ingénieur-chercheur à la Direction des
Sciences du Vivant du CEA. Il travaille au sein du laboratoire LNAO
situé à NeuroSpin. Il fait également partie des personnels de l’IFR 49.
Il est un des architectes historiques du projet BrainVISA. Ses activités
de recherche concernent principalement l’analyse structurelle du cerveau
humain avec de l’imagerie par résonance magnétique (IRM) et
plus particulièrement l’étude de la connectivité cérébrale à partir
d’IRM de diffusion.
--
Daniela Becker
Responsable administrative du LRDE