Annonce May 2010

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[Lrde] Séminaire Performance et Généricité du LRDE le mercredi 2 juin 2010

by Daniela Becker

Bonjour, La prochaine session du séminaire Performance et Généricité du LRDE (Laboratoire de Recherche et Développement de l'EPITA) aura lieu ce mercredi 2 juin 2010 (14h-17h) en Amphi 4 au Kremlin-Bicêtre. Au programme: * 14h: Généricité et topologie discrète en C++ -- Julien Lamy http://www-ulpmed.u-strasbg.fr/ipb/ Le traitement d'images est par nature un procédé discret, au cours duquel un signal continu est décomposé en un ensemble de pixels, ou de voxels pour des images tri-dimensionnelles. Au niveau géométrique, cette nature discrète pose peu de problèmes, car la plupart des opérations géométriques sont indépendantes de la grille sous-jacente ; au niveau topologique, le problème est tout autre. Deux des notions fondamentales de la topologie, le voisinage et la connexité, sont radicalement différentes entre un espace continu et un espace discret : il est entre autres impossible de subdiviser un voisinage discret de façon infinie comme c'est le cas dans un espace euclidien. Bien que certaines bibliothèques de traitement d'images contiennent des algorithmes topologiques, notamment de squelettisation, le type de voisinage utilisé par ces algorithmes est généralement fixé par le code, ce qui empêche une adaptation facile à un autre type de connexité ou à un espace de dimension différente. Ce séminaire présente une méthode générique pour intégrer les notions discrètes de voisinage et de connexité à une bibliothèque de traitement d'images programmée en C++. Je montrerai également comment obtenir de façon simple un algorithme de squelettisation homotopique en utilisant ces notions. -- Julien Lamy est titulaire d'un doctorat de l'Université de Strasbourg. De 2001 à 2006, il a travaillé au sein de l'équipe de R&D de l'IRCAD (Institut de recherche contre les cancers de l'appareil digestif, Strasbourg) au développement d'algorithmes de traitement d'images médicales. Depuis 2008, il est ingénieur de recherche au Laboratoire d'imagerie et de neurosciences cognitives de l'Université de Strasbourg. * 15h: Interface générique pour la parallélisation d’applications de recherche en imagerie biomédicale -- Yann Cointepas http://www.lnao.fr/ Le projet BrainVISA (http ://brainvisa.info) est en train de développer, avec le soutien du projet européen HiPiP (http ://hipip. eu), une architecture générique pour la parallélisation des applications. Cette architecture fournira un accès à divers moyens de calculs (fermes de stations de travail, clusters, centres de calculs, etc.) en s’appuyant sur des solutions existantes pour la gestion des ressources (Sun Grid Engine, Condor, LSF, etc.) Cette architecture est développée pour répondre aux besoins croissants de moyens de calcul dans le monde de la recherche en neuroimagerie. Au cours de ce séminaire, j’aborderai rapidement le contexte de la recherche en neuroimagerie en me focalisant sur les besoins en parallélisation d’applications. Ensuite, je détaillerai la solution que nous avons choisie pour répondre à ces besoins. -- Yann Cointepas a obtenu un doctorat de Traitement du signal et des images à l’Ecole Nationale des Télécommunications de Paris en 1999. Depuis 2003, il a un poste d’ingénieur-chercheur à la Direction des Sciences du Vivant du CEA. Il travaille au sein du laboratoire LNAO situé à NeuroSpin. Il fait également partie des personnels de l’IFR 49. Il est un des architectes historiques du projet BrainVISA. Ses activités de recherche concernent principalement l’analyse structurelle du cerveau humain avec de l’imagerie par résonance magnétique (IRM) et plus particulièrement l’étude de la connectivité cérébrale à partir d’IRM de diffusion. -- Daniela Becker Responsable administrative du LRDE

14 years, 6 months

New publication: ICIP 2010: Why and How to Design a Generic and Efficient Image Processing Framework: The Case of the Milena Library

by Roland Levillain

We are happy to announce that the following paper has been accepted for publication at the 2010 International Conference on Image Processing (ICIP) that will take place in Hong Kong on September 26 - 29, 2010: Roland Levillain (1,2), Thierry Géraud (1,2) and Laurent Najman (2) Why and How to Design a Generic and Efficient Image Processing Framework: The Case of the Milena Library http://publis.lrde.epita.fr/201009-ICIP (1) EPITA Research and Development Laboratory (LRDE) (2) Université Paris-Est, Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge, Equipe A3SI, ESIEE Paris Most image processing frameworks are not generic enough to provide true reusability of data structures and algorithms. In fact, genericity allows users to write and experiment virtually any method on any compatible input(s). In this paper, we advocate the use of generic programming in the design of image processing software, while preserving performances close to dedicated code. The implementation of our proposal, Milena, a generic and efficient library, illustrates the benefits of our approach. -- Roland Levillain - LRDE/EPITA - A3SI/ESIEE/IGM/UMLV-Paris Est EPITA Research and Development Laboratory (LRDE) 14-16, rue Voltaire - FR-94276 Le Kremlin-Bicêtre Cedex - France Phone: +33 1 53 14 59 45 - Fax: +33 1 53 14 59 22 - www.lrde.epita.fr

14 years, 6 months

Séminaire Performance et Généricité du LRDE le mercredi 2 juin 2010

by Thierry GERAUD

Chers collègues, La prochaine session du séminaire Performance et Généricité du LRDE (Laboratoire de Recherche et Développement de l'EPITA) aura lieu le mercredi 2 juin 2010 (14h-16h). Au programme: Généricité et topologie discrète en C++ --- Julien Lamy Le traitement d'images est par nature un procédé discret, au cours duquel un signal continu est décomposé en un ensemble de pixels, ou de voxels pour des images tri-dimensionnelles. Au niveau géométrique, cette nature discrète pose peu de problèmes, car la plupart des opérations géométriques sont indépendantes de la grille sous-jacente ; au niveau topologique, le problème est tout autre. Deux des notions fondamentales de la topologie, le voisinage et la connexité, sont radicalement différentes entre un espace continu et un espace discret : il est entre autres impossible de subdiviser un voisinage discret de façon infinie comme c'est le cas dans un espace euclidien. Bien que certaines bibliothèques de traitement d'images contiennent des algorithmes topologiques, notamment de squelettisation, le type de voisinage utilisé par ces algorithmes est généralement fixé par le code, ce qui empêche une adaptation facile à un autre type de connexité ou à un espace de dimension différente. Ce séminaire présente une méthode générique pour intégrer les notions discrètes de voisinage et de connexité à une bibliothèque de traitement d'images programmée en C++. Je montrerai également comment obtenir de façon simple un algorithme de squelettisation homotopique en utilisant ces notions. Julien Lamy est titulaire d'un doctorat de l'Université de Strasbourg. De 2001 à 2006, il a travaillé au sein de l'équipe de R&D de l'IRCAD (Institut de recherche contre les cancers de l'appareil digestif, Strasbourg) au développement d'algorithmes de traitement d'images médicales. Depuis 2008, il est ingénieur de recherche au Laboratoire d'imagerie et de neurosciences cognitives de l'Université de Strasbourg. http://www-ulpmed.u-strasbg.fr/ipb/ Interface générique pour la parallélisation d'applications de recherche en imagerie biomédicale --- Yann Cointepas Le projet BrainVISA (http://brainvisa.info) est en train de développer, avec le soutien du projet européen HiPiP (http://hipip.eu), une architecture générique pour la parallélisation des applications. Cette architecture fournira un accès à divers moyens de calculs (fermes de stations de travail, clusters, centres de calculs, etc.) en s'appuyant sur des solutions existantes pour la gestion des ressources (Sun Grid Engine, Condor, LSF, etc.) Cette architecture est développée pour répondre aux besoins croissants de moyens de calcul dans le monde de la recherche en neuroimagerie. Au cours de ce séminaire, j'aborderai rapidement le contexte de la recherche en neuroimagerie en me focalisant sur les besoins en parallélisation d'applications. Ensuite, je détaillerai la solution que nous avons choisie pour répondre à ces besoins. Yann Cointepas a obtenu un doctorat de Traitement du signal et des images à l'Ecole Nationale des Télécommunications de Paris en 1999. Depuis 2003, il a un poste d'ingénieur-chercheur à la Direction des Sciences du Vivant du CEA. Il travaille au sein du laboratoire LNAO situé à NeuroSpin. Il fait également partie des personnels de l'IFR 49. Il est un des architectes historiques du projet BrainVISA. Ses activités de recherche concernent principalement l'analyse structurelle du cerveau humain avec de l'imagerie par résonance magnétique (IRM) et plus particulièrement l'étude de la connectivité cérébrale à partir d'IRM de diffusion. http://www.lnao.fr/ Pour plus de renseignements, consultez http://seminaire.lrde.epita.fr/. L'entrée du séminaire est libre. Merci de bien vouloir diffuser cette information le plus largement possible.

14 years, 7 months

L'air de rien 19

by Daniela Becker

Bonjour, nous avons le plaisir de vous annoncer l sortie du n°19 du bulletin du LRDE. C'est un numéro qui présente le parcours d'un ancien élève du LRDE, puis la recherche du groupe Olena en collaboration avec l'IGR. Le projet SPOT a fait l'objet de deux releases. Vous y trouverez les dernières publications et l'annonce du prochain séminaire LRDE du 2 juin 2010. Vous pouvez télécharger le bulletin en couleur à la page suivante : http://publis.lrde.epita.fr/201005-l-air-de-rien-19 -- Daniela Becker Responsable administrative du LRDE

14 years, 7 months

New publication: WADGMM 2010: Writing Reusable Digital Geometry Algorithms in a Generic Image Processing Framework

by Roland Levillain

We are happy to announce that the following paper has been accepted for publication at the Workshop on Applications of Digital Geometry and Mathematical Morphology (WADGMM) that will take place in Istanbul, Turkey on August 22, 2010: Roland Levillain (1,2), Thierry Géraud (1,2) and Laurent Najman (2) Writing Reusable Digital Geometry Algorithms in a Generic Image Processing Framework http://publis.lrde.epita.fr/201008-WADGMM (1) EPITA Research and Development Laboratory (LRDE) (2) Université Paris-Est, Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge, Equipe A3SI, ESIEE Paris Digital Geometry software should reflect the generality of the underlying mathematics: mapping the latter to the former requires genericity. By designing generic solutions, one can effectively reuse digital geometry data structures and algorithms. We propose an image processing framework centered on the Generic Programming paradigm in which an algorithm on the paper can be turn into a single code, written once and usable with various input types. This approach enables users to design and implement new methods at a lower cost, try cross-domain experiments and help generalize results. -- Roland Levillain - LRDE/EPITA - A3SI/ESIEE/IGM/UMLV-Paris Est EPITA Research and Development Laboratory (LRDE) 14-16, rue Voltaire - FR-94276 Le Kremlin-Bicêtre Cedex - France Phone: +33 1 53 14 59 45 - Fax: +33 1 53 14 59 22 - www.lrde.epita.fr

14 years, 7 months

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